1、工厂发生运费收入时：
借：应收账款——公司名称
贷：其他业务收入
应交税费——应交增值税（销项税额）
2、工厂发生运费支出且取得对应发票时：
借：管理费用——运费
应交税费——应交增值税（进项税额）
贷：应付账款——公司名称
借：应付账款——公司名称
贷：银行存款
工厂发生运费收入，应当设置“其他业务收入”以及“应交税费——应交增值税（销项税额）”科目进行核算；工厂发生运费支出且取得对应发票，应当设置“管理费用”以及“应交税费——应交增值税（进项税额）”科目进行核算。
