硝化细菌包括亚硝酸菌和硝酸菌，它是一类好氧性细菌，在氮循环水质净化过程中，扮演着很重要的角色，硝化细菌的主要作用有以下两点：
1、可以将它制成硝化细菌处理剂，用于控制养殖池水自生氨浓度，使用时可直接将该剂散布于池中，很快就能发挥除氨的功效。
2、在农业上可通过深耕、松土提高细菌活力，从而增加土壤肥力，但硝酸盐也极易通过土壤渗漏进入地下水，成为一种潜在的污染源。因此可以通过施入氮肥增效剂，也就是硝化抑制剂，以降低土壤硝化细菌的活动，减低土壤氮肥的损失和对环境的污染。
