含义不同。协定存款是指存款单位通过与开户行签订单位协定存款合同，在基本存款账户或一般存款账户之上开立协定存款账户，并约定结算户基本存款额度，由开户行将结算户中超过基本存款额度的存款转入协定存款账户，并按协定存款利率计息的存款。协议存款是一种大额存款方式，内容，标准由协议存款双方协商确定。
执行利率不一样。协定存款执行的是人民银行挂牌公告的利率，目前的利率是1.45%。协议存款的存款利率、存款期限、结息和付息方式、违约处罚标准均而普通存款的金额不限，期限灵活，利息由银行来规定。
