这两者的估值方法的不同。
市值法是根据持有债券的市值来进行估值，如果债券在市场上价格大涨，投资这只债券的基金净值也会跟着大涨，如果债券在市场上价格下跌，基金净值也会跟着下跌。市值法能够准确地反应基金的当前市场价值。
摊余成本法是以买入成本列示，按照票面利率（或商定利率）并考虑其买入时的溢价或折价，在其剩余期限内平均摊销，每日计提收益。这反映到基金产品的净值上，主要体现为净值波动极小、基本没有回撤等。
